Ihren Namen erhielt die Isar aus dem Indo-Germanischen bzw. Keltischen. Hier bedeutet „Isara“ „die Reißende“. Auch andere europäische Gewässer tragen diesen Namen. Der Eisack in Südtirol „Isarca“, in Frankreich das „Val d’Isère“ und im nordböhmischen Riesengebirge der Fluß Isara.